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Text File  |  1995-03-04  |  2.3 KB  |  49 lines
  1. *****************************
  2. * MCM2/3/5 family signature *
  3. *****************************
  4.  
  5. Proteins shown to be required for the initiation of eukaryotic DNA replication
  6. share a highly conserved domain of about 210 amino-acid residues [1,2,3].  The
  7. latter shows some similarities [4] with that of various other families of DNA-
  8. dependent ATPases. Proteins known to contain this domain are listed below.
  9.  
  10.  - Yeast minichromosome maintenance protein 2 (gene MCM2). MCM2 is  needed for
  11.    the efficient function of certain replication origins.
  12.  - Yeast minichromosome maintenance protein 3 (gene MCM3). MCM3 possibly plays
  13.    a  direct  role  in  the  initiation  of  chromosomal  DNA  replication  by
  14.    interacting directly with autonomously replicating sequences (ARS).
  15.  - Yeast minichromosome maintenance protein 5 (gene MCM5 or CDC46). Like  MCM2
  16.    and MCM3,   this  protein  is  also  involved  in  the  initiation  of  DNA
  17.    replication and  interacts   directly  with  replication origins. A partial
  18.    sequence of a human homolog is also available.
  19.  - Schizosaccharomyces pombe  cell  division  control protein 21 (gene cdc21).
  20.    This protein,  required  for  S  phase  execution,  has also been partially
  21.    sequenced in yeast, human and in Xenopus.
  22.  - Mammalian DNA polymerase alpha holoenzyme-associated protein P1.
  23.  - Caenorhabditis elegans hypothetical protein ZK632.1.
  24.  
  25. The presence of a putative ATP-binding  domain implies that these proteins may
  26. be involved in an ATP-consuming step in  the  initiation of DNA replication in
  27. eukaryotes.
  28.  
  29. As a signature pattern, we selected a  perfectly  conserved  heptapeptide that
  30. represents a special version of the B motif found in ATP-binding proteins.
  31.  
  32. -Consensus pattern: I-D-E-F-D-K-M
  33. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  34. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  35.  
  36. -Expert(s) to contact by email: Koonin E.V.
  37.                                 koonin@ncbi.nlm.nih.gov
  38.  
  39. -Last update: June 1994 / Text revised.
  40.  
  41. [ 1] Coxon A., Maundrell K., Kearsey S.E.
  42.      Nucleic Acids Res. 20:5571-5577(1992).
  43. [ 2] Hu B., Burkhart R., Schulte D., Musahl C., Knippers R.
  44.      Nucleic Acids Res. 21:5289-5293(1993).
  45. [ 3] Tye B.-K.
  46.      Trends Cell Biol. 4:160-166(1994).
  47. [ 4] Koonin E.V.
  48.      Nucleic Acids Res. 21:2541-2547(1993).
  49.